Karakteristik struktural sareng klasifikasi péptida transmémbran

Aya seueur jinis péptida transmémbran, sareng klasifikasina dumasar kana sipat fisik sareng kimia, sumber, mékanisme ingestion, sareng aplikasi biomedis.Numutkeun sipat fisik jeung kimia maranéhanana, péptida penetrating mémbran bisa dibagi kana tilu tipe: kationik, amphiphilic jeung hidrofobik.Péptida penetrasi mémbran kationik sareng amphifilik 85%, sedengkeun péptida anu nembus mémbran hidrofobik ngan ukur 15%.

1. mémbran kationik penetrating péptida

Péptida transmémbran kationik diwangun ku péptida pondok anu beunghar ku arginin, lisin, sareng histidin, sapertos TAT, Penetratin, Poliarginin, P22N, DPV3 sareng DPV6.Di antarana, arginin ngandung guanidine, nu bisa beungkeut hidrogén jeung gugus asam fosfat muatan négatip dina mémbran sél jeung nyapih péptida transmembrane kana mémbran dina kaayaan nilai PH fisiologis.Studi ngeunaan oligarginin (tina 3 R dugi ka 12 R) nunjukkeun yén kamampuan penetrasi mémbran ngan ukur dihontal nalika jumlah arginin sahandapeun 8, sareng kamampuan penetrasi mémbran laun-laun ningkat kalayan paningkatan jumlah arginin.Lisin, sanajan kationik kawas arginin, teu ngandung guanidine, jadi lamun eta aya nyalira, efisiensi penetrasi mémbran na teu pisan tinggi.Futaki et al.(2001) kapanggih yén pangaruh penetrasi mémbran alus bisa dihontal ngan lamun mémbran sél kationik penetrating péptida ngandung sahanteuna 8 asam amino muatan positif.Sanajan résidu asam amino nu muatanana positip penting pisan pikeun péptida penetratif pikeun nembus mémbran, asam amino séjén sarua pentingna, saperti nalika W14 mutates jadi F, penetrability of Penetratin leungit.

Kelas husus péptida transmémbran kationik nyaéta runtuyan lokalisasi nuklir (NLSs), nu diwangun ku péptida pondok beunghar arginin, lisin jeung prolin tur bisa diangkut ka inti ngaliwatan kompléks pori nuklir.NLSs tiasa dibagi deui kana ngetik tunggal sareng ganda, masing-masing diwangun ku hiji sareng dua gugus asam amino dasar.Contona, PKKKRKV tina virus simian 40(SV40) nyaéta NLS ngetik tunggal, sedengkeun protéin nuklir nyaéta NLS ngetik ganda.KRPAATKKAGQAKKKL nyaéta runtuyan pondok anu bisa maénkeun peran dina mémbran transmembrane.Kusabab sabagéan ageung NLS gaduh nomer muatan kirang ti 8, NLS sanés péptida transmémbran anu mujarab, tapi tiasa janten péptida transmémbran anu épéktip nalika dihubungkeun sacara kovalén kana sekuen péptida hidrofobik pikeun ngabentuk péptida transmémbran amphiphilic.

struktural-2

2. Péptida transmémbran amphiphilic

Péptida transmémbran amphiphilic diwangun ku domain hidrofilik jeung hidrofobik, nu bisa dibagi kana amphiphilic primér, α-hélik sekundér amphiphilic, β-folding amphiphilic jeung prolin-enriched amphiphilic.

Péptida mémbran amfilik tipe primér jadi dua kategori, kategori kalawan NLSs kovalén dihubungkeun ku runtuyan péptida hidrofobik, kayaning MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) jeung Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Duanana dumasar kana sinyal lokalisasi nuklir PK40RKV, nu SVKKRKV tina sinyal lokalisasi nuklir. domain MPG patali jeung runtuyan fusi glikoprotein HIV 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), jeung domain hidrofobik of Pep-1 patali jeung triptofan gugus euyeub ku pangirut mémbran tinggi (KETWWET WWTEW).Tapi, domain hidrofobik duanana disambungkeun jeung sinyal lokalisasi nuklir PKKKRKV ngaliwatan WSQP.Kelas séjén péptida transmémbran amfilik primér diisolasi tina protéin alami, sapertos pVEC, ARF (1-22) sareng BPrPr (1-28).

Péptida transmémbran amphiphilic α-hélik sekundér ngabeungkeut mémbran ngaliwatan α-héliks, sareng résidu asam amino hidrofilik sareng hidrofobikna aya dina permukaan anu béda dina struktur hélik, sapertos MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Pikeun mémbran maké amphiphilic tipe lipatan péptida béta, kamampuhna pikeun ngabentuk lambaran béta pleated penting pisan pikeun kamampuh penetrasi mémbran na, kayaning di VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) dina prosés panalungtikan kamampuh penetrasi mémbran, ngagunakeun tipe D. - analog mutasi asam amino teu bisa ngabentuk béta narilep sapotong, kamampuh penetrasi mémbran pisan goréng.Dina péptida transmémbran amphiphilic prolin-enriched, polyproline II (PPII) gampang kabentuk dina cai murni lamun prolin ieu kacida enriched dina struktur polipéptida.PPII nyaéta héliks leungeun kénca kalawan 3,0 résidu asam amino per péngkolan, sabalikna tina struktur alfa-héliks leungeun katuhu standar kalawan 3,6 résidu asam amino per péngkolan.Péptida transmémbran amphiphilic-enriched proline kaasup péptida antimikrobial bovine 7 (Bac7), polipéptida sintétik (PPR) n (n tiasa 3, 4, 5 jeung 6), jsb.

struktural-3

3. mémbran hidrofobik penetrating péptida

Péptida transmémbran hidrofobik ngan ngandung résidu asam amino non-polar, kalayan muatan bersih kurang ti 20% tina total muatan tina runtuyan asam amino, atawa ngandung gugus hidrofobik atawa gugus kimia nu penting pikeun transmémbran.Sanajan péptida transmémbran sélular ieu mindeng overlooked, aranjeunna aya, kayaning faktor pertumbuhan fibroblast (K-FGF) jeung faktor pertumbuhan fibroblast 12 (F-GF12) ti sarcoma Kaposi urang.


waktos pos: Mar-19-2023