Skéma desain sareng solusi ranté péptida polipéptida

I. Ringkesan
Péptida mangrupa makromolekul husus sahingga runtuyanna teu ilahar dina ciri kimiawi jeung fisikna.Sababaraha péptida hese disintésis, sedengkeun anu sanésna gampang disintésis tapi hésé dimurnikeun.Masalah praktis nyaéta paling péptida rada leyur dina leyuran cai, jadi dina purifikasi urang, bagian pakait tina péptida hidrofobik kudu leyur dina pangleyur non-cai, Ku alatan éta, pangleyur atawa buffers ieu kamungkinan jadi parah inconsistent jeung pamakéan tina prosedur eksperimen biologis, ku kituna teknisi dilarang pisan ngagunakeun péptida pikeun kaperluan sorangan, ku kituna di handap ieu sababaraha aspék desain péptida pikeun peneliti.

Skéma desain sareng solusi ranté péptida polipéptida
Kadua, pilihan bener tina péptida susah sintétik
1. Total panjang runtuyan handap-diatur
Péptida kirang ti 15 résidu langkung gampang dimeunangkeun sabab ukuran péptida ningkat sareng kamurnian produk atah turun.Nalika total panjang ranté péptida naék langkung ti 20 résidu, kuantitas produk anu tepat mangrupikeun perhatian utama.Dina loba percobaan, éta gampang pikeun meunangkeun épék teu kaduga ku nurunkeun jumlah résidu handap 20.
2. Ngurangan jumlah résidu hidrofobik
Péptida kalawan predominance badag résidu hidrofobik, utamana di wewengkon 7-12 résidu ti C-terminus, biasana ngabalukarkeun kasusah sintétik.Ieu katempona kombinasi inadequate persis sabab lambar B-melu dicandak dina sintésis."Dina kasus sapertos kitu, tiasa mangpaat pikeun ngarobih langkung ti dua résidu positip sareng négatip, atanapi nempatkeun Gly atanapi Pro kana péptida pikeun muka konci komposisi péptida."
3. Downregulation résidu "hésé".
"Aya sababaraha résidu Cys, Met, Arg, sareng Try anu umumna henteu gampang disintésis."Ser bakal ilaharna dipaké salaku alternatif nonoxidative mun Cys.
Skéma desain sareng solusi ranté péptida polipéptida

Katilu, ningkatkeun pilihan bener leyur dina cai
1. Saluyukeun N atawa C terminal
Relatif ka péptida asam (nyaéta, muatan négatip dina pH 7), asetilasi (N-terminus asetilasi, C terminal salawasna ngajaga gugus karboksil bébas) utamana dianjurkeun pikeun ngaronjatkeun muatan négatip.Tapi, pikeun péptida dasar (nyaéta, muatan positif dina pH 7), aminasi (gugus amino bébas dina N-terminus jeung amination di C-terminus) utamana dianjurkeun pikeun ngaronjatkeun muatan positif.

2. Gede pisan pondok atawa manjangkeun runtuyan

Sababaraha sekuen ngandung sajumlah ageung asam amino hidrofobik, sapertos Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr sareng Ala, jsb. Nalika résidu hidrofobik ieu ngaleuwihan 50%, aranjeunna biasana henteu gampang larut.Bisa jadi mangpaat pikeun manjangkeun runtuyan pikeun salajengna ngaronjatkeun kutub positif jeung negatif péptida.Pilihan kadua nyaéta nurunkeun ukuran ranté péptida pikeun ningkatkeun kutub positip sareng négatif ku cara ngirangan résidu hidrofobik.Beuki kuat sisi positip jeung négatif ranté péptida, beuki kamungkinan réaksina jeung cai.
3. Pasang dina résidu larut cai
Kanggo sababaraha ranté péptida, kombinasi sababaraha asam amino positip sareng négatip tiasa ningkatkeun kaleyuran cai.Perusahaan kami nyarankeun N-terminus atanapi C-terminus péptida asam pikeun digabungkeun sareng Glu-Glu.Terminal N atanapi C tina péptida dasar dibéré lajeng Lys-Lys.Lamun grup muatan teu bisa ditempatkeun, Ser-Gly-Ser ogé bisa ditempatkeun dina N atawa C terminal.Nanging, pendekatan ieu henteu tiasa dianggo nalika sisi ranté péptida teu tiasa dirobih.